Fly Brain HubFlyEM Optic Lobe Connectome
HHMI Janelia FlyEM Project Team with Google Connectomics
ジャネリアFlyEMがGoogleのコネクトミクスグループと共同で作成した、成体オスのショウジョウバエ右視葉（視覚処理領域）の完全な配線図。700種類以上・5万超のニューロン（内在性約16,000、接続性約32,000など）を収録し、2024年のデータ公開後、neuPrint上でoptic-lobe v1.1として提供されている。視覚系全体の細胞型目録をまとめた論文は2025年にNature誌に掲載された。
確認した出典
上の情報は掲載日にこれらのページを読んで確認したものです。
- janelia.org https://www.janelia.org/project-team/flyem/optic-lobe
- janelia.org https://www.janelia.org/project-team/flyem
利用: 2 件
coconatfly
Gregory Jefferis (natverse)
主要なハエのコネクトームを共通のインターフェースで扱えるようにする R パッケージ。hemibrain・FlyWire・MANC・FANC・BANC・male CNS・male optic lobe に対して、同じ書き方で結合相手の検索や細胞タイプの比較ができる。Jefferis 氏が開発しており、ライフサイクルは実験段階で API が変わる可能性はあるものの、hemibrain と FlyWire の比較では既に実用されている。
FlyWire Codex
Princeton Neuroscience Institute
Princeton Neuroscience Institute が開発した Web ベースのコネクトーム閲覧ツール。ソフトのインストールも生データのダウンロードも不要で、ブラウザだけで検索・絞り込み・可視化ができる。FlyWire の FAFB v783（139,255 ニューロン）に加え、BANC v888、Janelia の MANC v1.2.1、オス視葉 MAOL v1.1、male CNS v1.0 も閲覧でき、2026 年初頭時点で登録ユーザーは 6 万人を超えた。コードは murthylab/codex として Apache-2.0 で公開されている。