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データセット・コネクトーム

ハエの脳・神経索のシナプス解像度の配線図と、その入手先。

8 件

データセット・コネクトーム

BANC (Brain And Nerve Cord)

Harvard Medical School (Lee & Wilson labs), Princeton University (Murthy lab), Harvard (Drugowitsch lab)

ハーバード医学部のLee研・Wilson研とプリンストン大学Murthy研などが中心となり、成体メスのショウジョウバエ1個体を4nm解像度の連続切片EMで撮像し、脳と腹部神経索を同じ個体でひとつながりにシナプス解像度で再構成したコネクトーム(同一個体で両方を扱うのはこれが初)。READMEによると約188,000ニューロン・約1億9,900万の予測シナプスを含み、解析コード(主にR)とデータはいずれもCC BY 4.0で公開。論文は2026年にNature誌にオープンアクセスで掲載された。

CC-BY-4.0★ 7
データセット・コネクトーム

FlyWire (FAFB v783)

Princeton University (Murthy & Seung labs) with the FlyWire consortium

プリンストン大学が主導し、成体メスのショウジョウバエ全脳をFAFB電子顕微鏡画像からAIで再構成し、世界中の研究者による校正で仕上げたコネクトーム。v783にはCodex上で139,255個の校正済みニューロンと数千万のシナプス(神経伝達物質予測付き)が収録され、2024年にNature誌で主要論文が公開された。

CC-BY-NC-4.0
データセット・コネクトーム

Larval Drosophila Brain Connectome (Winding et al. 2023)

University of Cambridge (Michael Winding et al.)

Michael Winding(ケンブリッジ大学)を筆頭とする研究チームが2023年3月にScience誌で発表した、昆虫の脳全体を対象とする完全なシナプス配線図。1齢幼虫のショウジョウバエ脳を対象に3,016ニューロン・約548,000シナプスを再構成し、多感覚統合や左右半球間の連絡、再帰的な回路構造が広く見られることを示した。

CC-BY-4.0
データセット・コネクトーム

MaleCNS v1.0

HHMI Janelia FlyEM / University of Cambridge / MRC LMB / Google Research

オスのショウジョウバエ成虫の中枢神経系(脳・視葉・腹側神経索)をひとつの体積として再構成した初の全配線図。16 万以上のニューロンを含み、CC-BY で公開されている。2026 年 9 月のハエ脳デモの波はこのデータから始まった。

CC-BY-4.0
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FANC (Female Adult Nerve Cord)

Harvard Medical School (Wei-Chung Allen Lee lab)

ハーバード医学部Lee研が成体メスのショウジョウバエの腹部神経索をGridTape-TEMで撮像し、自動再構成と有志による校正を進めている連結体データ。元の画像データは2021年にCell誌、コネクトーム再構成はAzevedoらにより2024年にNature誌で発表された。このリポジトリではpipで導入できるPythonパッケージfanc-fly(GPL-3.0)とWikiを提供しており、fanc.communityからもここへ誘導される。

unknown★ 15
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Hemibrain

HHMI Janelia Research Campus (FlyEM Project Team)

HHMIジャネリア研究所のFlyEMチームが公開した、ショウジョウバエ中心脳の大部分(キノコ体や中心複合体を含む)のシナプスレベル再構成データ。約25,000個のニューロンを数千の細胞型に分類しており、2020年1月にv1.0、同年12月にv1.2がリリースされた。概要論文はeLife誌に掲載され、neuPrintから閲覧できる。

CC-BY-4.0
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MANC (Male Adult Nerve Cord)

HHMI Janelia FlyEM, Cambridge Connectomics Group, Google Research

成体オスのショウジョウバエの腹部神経索(ヒトの脊髄に相当し、運動制御を担う部位)を丸ごと再構成したコネクトーム。ジャネリアFlyEMがケンブリッジ大学やGoogle Researchと共同で2023年6月にv1.0を公開し、2024年3月にv1.2へ更新。約23,000ニューロンと約1,000万のシナプス前部位を含み、3本の関連論文がeLife誌に掲載された。

CC-BY-4.0
データセット・コネクトーム

FlyEM Optic Lobe Connectome

HHMI Janelia FlyEM Project Team with Google Connectomics

ジャネリアFlyEMがGoogleのコネクトミクスグループと共同で作成した、成体オスのショウジョウバエ右視葉(視覚処理領域)の完全な配線図。700種類以上・5万超のニューロン(内在性約16,000、接続性約32,000など)を収録し、2024年のデータ公開後、neuPrint上でoptic-lobe v1.1として提供されている。視覚系全体の細胞型目録をまとめた論文は2025年にNature誌に掲載された。