ツール・ライブラリ

connectome_data_prep

Yijie Yin, University of Cambridge

ケンブリッジ大学の Yijie Yin 氏による、公開コネクトームを解析しやすい疎結合行列とメタデータ表に整形するためのノートブック・スクリプト集。flow centrality に基づく軸索・樹状突起の分割処理も含む。対象は成虫の male CNS・BANC・FlyWire/FAFB・hemibrain・MANC に加えて幼虫コネクトームで、Connectome Interpreter で使う経路探索・実効結合解析のベンチマークコードも同梱されている。ライセンスファイルは未設定。

公式サイト ↗

connectome_data_prep

#data-preprocessing#sparse-matrices#axon-dendrite-split#multi-dataset#notebooks

確認した出典

上の情報は掲載日にこれらのページを読んで確認したものです。

  • github.com https://github.com/YijieYin/connectome_data_prep
  • api.github.com https://api.github.com/repos/YijieYin/connectome_data_prep
  • github.com https://github.com/YijieYin/connectome_data_prep/commits/main