Fly Brain HubEnglish

ツール・ライブラリ

NAVis

navis-org (Fly Connectomics group, Cambridge)

ニューロンのスケルトン・メッシュ・dotprops・画像ボリュームを統一的に扱う Python ライブラリ。2D/3D 描画、形態計測、NBLAST による類似度比較、テンプレート脳間の座標変換を備える。ケンブリッジのハエ・コネクトミクス界隈で R の natverse と対をなす形で開発され、neuPrint や（fafbseg 経由で）FlyWire/FAFB と連携する。重い処理は navis-fastcore として Rust 化されている。

公式サイト ↗

NAVisnavis-org/navis docs (GPL-3.0)

#neuron-analysis#morphology#nblast#visualization#python-library

確認した出典

上の情報は掲載日にこれらのページを読んで確認したものです。