SIFa Connectome Analysis
szac74
SIFamide の研究に使われたコネクトーム解析を再実行するためのコード。元の解析は neuPrint 上で Cypher クエリと段階的なメッシュ計算を対話的に行ったもので、一本の解析スクリプトは残っていない。そこでクエリの論理・ニューロン ID・絞り込み規則・部位のメタデータをまとめ直し、hemibrain v1.2.1 と male-cns v1.0 に対して論文の数値を再現できる形にしてある。検証スクリプトが主要な合計値を照合し、著者はすべて一致したと報告する。メッシュ間距離はあくまで近接のスクリーニング指標で、それ自体はシナプス結合の証拠ではないと README は明記する。
確認した出典
上の情報は掲載日にこれらのページを読んで確認したものです。
- raw.githubusercontent.com https://raw.githubusercontent.com/szac74/SIFa-connectome-analysis/HEAD/README.md