ツール・ライブラリ

FruitFlyBrain (datasets and projects)

ROHITCRAFTSYT

ログイン不要で手に入る 2 つのコネクトームの上に、実際に動く 8 つのプロジェクトを並べた作業場。hemibrain v1.2 が 21,739 ニューロン・355 万接続・1,430 万シナプス、FlyWire FAFB の注釈が 139,248 ニューロン・8,840 細胞型。中身はグラフ解析、神経伝達物質と細胞型の集計、最短経路による回路追跡、コネクトームで配線したネットワークのシミュレーション、NAVis による 3D 描画、細胞型分類器、ニューロン埋め込み、シナプスのリンク予測で、それぞれが自分の図と CSV を書き出す。いくつかは既知のハエ神経科学と突き合わせる健全性チェックを持ち、出典・ライセンス・チェックサム・引用は datasets フォルダにまとまっている。

公式サイト ↗

FruitFlyBrain (datasets and projects)

#navis#graph-analysis#link-prediction#cell-type#checksums#starter-kit

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