FDDD (Fly-Driven Drug Development)

タンパク質と低分子のあいだを最大 20 匹の独立した MaleCNS モデルのハエが飛び回り、あらかじめ計算しておいた AutoDock Vina のドッキングスコアから候補ごとの選好を学ぶ、ブラウザ上の研究デモ。1 匹ごとに選択した 167,122 ニューロン・6,241,236 本の有向結合（シナプス 5 個以上の結合のみ）を訪問者のブラウザ内で計算し、活動は実測された細胞体位置 28,195 点の上に描かれる。報酬は味覚として注釈された 1,428 ニューロンに入力される。実行済みの組み合わせはタンパク質 3 種・分子 6 種から 8 通り。ドッキングスコアは実験で測った結合親和性でも薬効でもなく、ネットワークが結合力を自力で見つけたわけでもないと明記している。

公式サイト ↗リポジトリ ↗

#molecular-docking#autodock-vina#browser#preference-learning#webgpu#malecns