Drosophila MaleCNS Perturbomics
Guillermo de Anda-Jauregui
MaleCNS コネクトームの注釈済み細胞型ユニットを一つずつ摂動し、その影響が下流のエフェクタ群にどこまで届くかをまとめる R のパイプライン。入力で正規化したシナプス数の線形伝播モデルを使う。解析前に 4 つの仮説(摂動空間は低次元か、細胞型は専門家型か汎用型か、解剖学的に別の型が似た効果を出すか、既報の下行ニューロン表現型が予測類似度と合うか)を明示している。伝達物質の符号は全クラスで信頼できないという理由から、モデルはあえて符号なし。スペクトル半径・シナプス閾値・エフェクタ分類はいずれも感度解析で振っている。
確認した出典
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- raw.githubusercontent.com https://raw.githubusercontent.com/guillermodeandajauregui/dm_connectome_perturbome/HEAD/README.md