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Wired Different (ConnectomeLens)

Dhruvin Sarkar (@dhruvin-sarkar)

MaleCNS v1.0 から雄のデータだけで細胞タイプのグラフ（11,751 タイプ・243,439 エッジ）を組み、勾配ブースティングの分類器で Janelia が公開した male-specific / dimorphic のラベルを予測する。さらに次数を保ったまま配線を組み替えた 500 個のグラフと比べ、実際の配線が効いているかを検定する。全特徴量では AUC-PR 0.759 対 帰無 0.712、より切れ味の鋭いトポロジーのみの条件では 0.489 対 0.070±0.004（p = 0.002）。主張の扱いが厳格で、「言ってよいこと」と「決して言ってはいけないこと」を明記し、上位に挙がった 2 タイプは発見ではなく候補と呼び、事前に決めた検証のうち失敗した 1 件もそのまま公開している。サイトでは分布図・経路探索・当てものゲームの 3 つを触れる。

公式サイト ↗リポジトリ ↗

Wired Different (ConnectomeLens)

#machine-learning#sexual-dimorphism#cell-types#null-model#malecns

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