FlyBrainFM / connectome-lab

MaleCNS v1.0 の全データをノート PC で扱えるようにしたグラフ機械学習の土台。公開バケットから注釈・神経伝達物質・1.1 GB の結合重みを取得し、疎な有向グラフを作り、ランダム化 SVD で各ニューロンの出力側・入力側の埋め込みを別々に学習する。その教師なし埋め込みが class などの生物学的ラベルをどれだけ復元するかを調べ、埋め込み空間で配線の似たニューロンを検索できる。PyTorch を入れればエッジ識別による埋め込みも学習できる。生データは再配布せず、公式リリースから各自が落とす作りになっている。

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