connectome-kit
aujurd22
大規模コネクトーム向けの解析ツールキット。約 17 万ニューロン・重複を除いた有向接続 1,360 万本のメス全中枢神経系データセットで構築・検証されている。読み込みと ID 対応、次数を保つ帰無モデル、行列累乗を避けた有向リングのサンプリング濃縮、スペクトルギャップとモジュール構造、神経伝達物質で層別した位相、有効情報、GPU 上の位相同期といったモジュールを持つ。各モジュールに対応するランダム対照が同梱され、濃縮の結果を必ず突き合わせられる。ローダーは任意のエッジリストを受け取れるので、特定データセット専用ではない。
確認した出典
上の情報は掲載日にこれらのページを読んで確認したものです。
- raw.githubusercontent.com https://raw.githubusercontent.com/aujurd22/connectome-kit/HEAD/README.md
- api.github.com https://api.github.com/repos/aujurd22/connectome-kit