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シミュレーション

Drosophila_brain_model (Shiu et al.)

Philip K. Shiu et al.

Shiu らの論文「A Drosophila computational brain model reveals sensorimotor processing」（Nature、2024 年 10 月）のリファレンス実装。FlyWire 全脳を対象にした漏れ積分発火モデルを Brian 2 上に構築している。FlyWire ID を指定してポアソン入力で活性化したり、抑制して光遺伝学的操作を模したりでき、スパイク時刻と発火率を出力する。コネクトームは v630 と v783 の両方に対応し、Jupyter のチュートリアルも付属。Eon Systems の fly-brain など後続プロジェクトがこのモデルを直接の土台にしている。

公式サイト ↗

Drosophila_brain_model (Shiu et al.)

#leaky-integrate-and-fire#whole-brain#brian2#nature-2024#optogenetics-in-silico

確認した出典

上の情報は掲載日にこれらのページを読んで確認したものです。

  • github.com https://github.com/philshiu/Drosophila_brain_model
  • api.github.com https://api.github.com/repos/philshiu/Drosophila_brain_model
  • ebi.ac.uk https://www.ebi.ac.uk/europepmc/webservices/rest/search?query=DOI:10.1038/s41586-024-07763-9&format=json&resultType=lite
  • github.com https://github.com/eonsystemspbc/fly-brain