Fly Neuron Atlas

mait (@mait2355n)

MaleCNS v1.0 の運動系まわりを、データと根拠の台帳としてまとめたリポジトリ。運動アノテーションのある 815 細胞すべてのカタログ（入力エッジ 330,888 本）、42 の筋群のうち 2 つ以上に届く上流候補 2,155 細胞（重み 10 以上）、うち 40 細胞の入出力エッジ全件、DNa01/DNa02 の電位記録 23 本の再解析表を収める。標準ライブラリだけの verify / reproduce スクリプトがエッジ数を数え直し、食い違えば非ゼロ終了する。限界を書いた文書には厄介な点も並ぶ。入力側 90,166 bodyId のうち 69,709 に注釈が無いこと、注釈だけに依存する運動ニューロン 44 個を外すと候補が 1,927 に減ること、配線はオス標本なのに生理記録はメス由来であること。

公式サイト ↗

#motor-neurons #malecns #electrophysiology #provenance #reproducibility

確認した出典

上の情報は掲載日にこれらのページを読んで確認したものです。

api.github.com https://api.github.com/repos/mait2355n/fly-neuron-atlas
raw.githubusercontent.com https://raw.githubusercontent.com/mait2355n/fly-neuron-atlas/HEAD/README.md
raw.githubusercontent.com https://raw.githubusercontent.com/mait2355n/fly-neuron-atlas/HEAD/README.en.md
raw.githubusercontent.com https://raw.githubusercontent.com/mait2355n/fly-neuron-atlas/HEAD/docs/limitations.md
raw.githubusercontent.com https://raw.githubusercontent.com/mait2355n/fly-neuron-atlas/HEAD/LICENSE
raw.githubusercontent.com https://raw.githubusercontent.com/mait2355n/fly-neuron-atlas/HEAD/scripts/verify.py
api.github.com https://api.github.com/repos/mait2355n/fly-neuron-atlas/contents/data